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单细胞测序服务

首页 > 基因测序 > 单细胞测序服务

单细胞测序服务


单细胞测序通过对单个细胞进行基因组扩增和测序,解决了用组织样本无法获得不同单个细胞的异质性信息、样本量太少无法进行常规测序的难题,为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向,为早期检测、诊断疾病及疾病的个体化治疗提供指导。

方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

单细胞测序可针对性揭示单个细胞整体水平的基因信息,解决了细胞异质性难题。获取单克隆细胞的突变来源及精准的突变频率,用来研究疾病以及癌症发生发展机制等。

Single cell 全基因组/外显子组测序

癌症基因组学

疾病基因组学

标准信息分析A

标准信息分析A+

标准信息分析Pro

去除接头污染序列及低质量数
据比对,产出数据统计SNP检
测、注释和统计InDel检测、注释和统计CNV检测、注释和统计(仅全基因组测序)SV检测、注释和统计(仅全基因组测序)

1. 数据质控:去除接头污染和
低质量数据
2. 与参考序列进行比对、统计
测序深度及覆盖度
3. Somatic SNV/InDel/CNV/SV检测、注释及统计(肿瘤成对样本)

1. 数据质控:去除接头污染和低质量数据
2. 与参考序列进行比对、统计测序深度及覆盖度
3. Somatic SNV/InDel/CNV/SV检
测、注释及统计(肿瘤成对样本)

4. 单细胞Germline SNP聚类分析
5. PAC(主成分)分析
6. Heatmap展示图(somatic
SNV)
7. 高频突变分析(>2对样本)
  7.1高频突变基因统计
  7.2高频突变基因富集分析
8. NMF突变特征/突变频谱分析
  8.1突变频谱分析
  8.2NMF突变特征分析
(>2对样本)

9. NovoDriver已知驱动基因筛选
10. 基因组变异Circos图展示

1. 样本间协同性分析(肿瘤单细胞样本数量≥2,且必须有组织样本)
2. MRT高频突变基因相关性分析(>2对样本)
  2.1高频突变基因协同作用分析
  2.2高频突变基因互斥作用分析
3. OncodriveCLUST驱动基因预测(>2对样本)
4. 突变位点分布情况分析
  4.1高频突变基因SNV/InDel突
变位点展示

  4.2预测驱动基因SNV/InDel突变位点展示

5. 高频CNV分析
  5.1 CNV分布分析
  5.2 CNV重现性分析(>2对样
本)
6. 杂合性缺失(LOH)分析
7. LOF蛋白功能缺失分析
8. NovoDrug高频突变基因靶向用药预测
9. NovoDR耐药突变筛选
10. NovoNoncoding非编码区高频突变分析(单细胞外显子测序仅不包括此分析)

* 定制化信息分析,可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容

基因组测序采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。科桥生物高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,以保证高效的数据处理和安全的数据存储。


定制化信息分析

针对不同项目,除了进行标准信息分析外,通过与合作伙伴共同探讨,制定可行的个性化信息分析方案,整合各种主流软件,优化分析结果,以确保结果的准确性及创新性。


询价及订购

感谢您选择科桥生物的单细胞基因组测序服务。如有任何相关的问题,请您联系我们的工作人员,我们尽快为您解答和服务。






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    15251896576(微信同号)
    025-85752084
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